Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms