Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms