Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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