Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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