Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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