Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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