Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TCEA2Q15560 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms