Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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