Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms