Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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