Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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