Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms