Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NBR1Q14596 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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NBR1Q14596 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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NBR1Q14596 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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