Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTTNQ14247 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms