Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COTL1Q14019 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms