Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CKAP5Q14008 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CKAP5Q14008 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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