Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APOFQ13790 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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