Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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