Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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