Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms