Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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