Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms