Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms