Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms