Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MDM2Q00987 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms