Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms