Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms