Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms