Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP4P49662 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms