Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms