Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms