Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPOP42166 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPOP42166 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms