Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms