Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms