Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms