Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD1P28340 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms