Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTSSP25774 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTSSP25774 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTSSP25774 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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