Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms