Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD58P19256 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD58P19256 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD58P19256 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD58P19256 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD58P19256 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD58P19256 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD58P19256 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD58P19256 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD58P19256 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD58P19256 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms