Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC192P0DO97 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms