Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI1P08151 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI1P08151 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI1P08151 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI1P08151 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI1P08151 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI1P08151 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms