Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms