Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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