Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms