Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms