Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms