Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms