Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP2BPQ9P2M1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms