Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms