Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CNIH4Q9P003 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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CNIH4Q9P003 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CNIH4Q9P003 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CNIH4Q9P003 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CNIH4Q9P003 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CNIH4Q9P003 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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